Bien qu'Android utilise le noyau linux et que linux puisse lire NTFS, NTFS est une technologie propriétaire de Microsoft et aucune des solutions open source n'est très bonne pour l'implémenter (et sont probablement soumises à des brevets donc non incluses dans un autre appareil commercial).
Android implémente les systèmes de fichiers FAT et EXT. Le meilleur système de fichiers sera probablement EXT4, mais vous ne pourrez le lire que dans d'autres machines Linux. Bien que je n'ai pas vérifié si android montera une carte SD formatée EXT.
Je sais que le stockage adoptable dans marshmallow utilise un système de fichiers ext4 crypté. Donc cela fonctionne.
Il y a longtemps, j'ai partitionné ma carte sd en un système de fichiers ext2 de 2gig puis une partition fat de 30 gig et j'ai piraté la séquence de démarrage pour monter le système de fichiers ext2 afin que les applications s'y installent, l'appareil (htc desire original) n'avait qu'environ 1 gig de stockage interne pour les applications, avant de pouvoir migrer les applications vers la carte sd. De plus, c'était mieux que la migration des applications SD, car même les apps qui prétendaient ne pas pouvoir fonctionner sur la carte SD s'y installaient.