Il y aura naturellement une multitude de réponses à cette question - puisqu'elle reste très personnelle par nature, et se résume à ce que vous avez essayé/entendu/se sentant à l'aise dans l'utilisation.
Cela étant dit - utiliser la technologie pour vous aider à gérer vos données est une simple évidence. Avec la facilité avec laquelle les données peuvent être accumulées, et la disponibilité toujours croissante des données - si vous ne maîtrisez pas vos informations dès le début, vous vous créez de sérieux maux de tête pour votre futur-soi. Faites l'effort maintenant, familiarisez-vous avec ce qui est disponible - et recommandé dans votre contexte académique spécifique, et commencez à l'utiliser.
J'opère avec le domaine des sciences sociales, plus précisément, le droit. J'ai décidé très tôt de ne pas avoir de gestionnaire de références faisant autre chose que gérer mes citations - c'est-à-dire l'insertion de références dans mon document/article/chapitre/dissertation - et la création automatisée d'une bibliographie, si nécessaire.
Alors que je pouvais demander au gestionnaire de références d'organiser ma bibliothèque, et d'annoter ces PDF en son sein, j'ai choisi de plutôt m'appuyer sur un gestionnaire d'informations dédié pour contrôler cet aspect des choses. Encore une fois, YMMV, mais ne négligez pas les avantages possibles de l'utilisation d'outils dédiés pour des aspects spécifiques de votre flux de travail - plutôt que d'utiliser un seul produit pour gérer le référencement, la recherche/le téléchargement, l'annotation, le balisage, l'organisation, la recherche etc. etc.
Ce que j'utilise :
(Mac OSX)
- Gestionnaire d'informations - DevonThink Pro Office et DevonThinkToGo (iOS)
- Gestionnaire de références - Bookends 12 et Bookends on Tap (iOS)
- Création - Scrivener (MS WORD)
- Annotation - Goodreader (iOS) ; LiquidText (Beta - iOS) ; Textwrangler - pour l'analyse des résumés d'annotation ; Highlights App (OSX) - analyse des informations d'annotation
- Contrôle/construction du flux de travail - Hazel 3.0 ; Keyboard Maestro ; ShorcatApp ; ActionsApp pour iPad ; Alfred ; Textexpander.
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