En cas de doute, GPT. Bien que vraiment, l'installation de Windows gère cela pour vous et vous n'aurez probablement jamais besoin de savoir même ce qui est utilisé.
Windows peut être installé sur les deux de manière égale, à lui de telles considérations ne comptent pas d'un iota. Le lecteur s'appellerait toujours C :, les fichiers seraient toujours dans l'exacte même structure de dossiers utilisant le même système de fichiers NTFS. Son chargeur de démarrage serait toujours placé de telle sorte que le firmware de la carte mère puisse le trouver et commencer à l'exécuter à la mise sous tension. Quel que soit le tour, que la table de partition du lecteur soit stockée dans la norme MBR ou dans la norme GPT.
Là où ça compte, c'est le matériel. Cette carte mère pourrait vous imposer GPT si vous souhaitez utiliser son option de démarrage UEFI/Sécurisé. Toutes ne le font pas, mais il y en a. Sinon, vous devrez peut-être activer son mode hérité du BIOS pour pouvoir démarrer à partir d'un disque MBR.
De plus, MBR est un peu restrictif. Il ne permet que 4 partitions primaires. Vous pouvez diviser l'une d'elles pour en partitions logiques étendues, et le démarrage sur MBR signifie que le programme de démarrage doit être situé à un endroit spécifique - il ne peut pas être sur n'importe quelle partition. GPT autorise plusieurs 100 partitions, toutes étant primaires, et il permet à n'importe laquelle d'entre elles d'être amorçable.
Plus important encore, de nombreux périphériques matériels (y compris certaines cartes mères) sont incompatibles avec les disques MBR s'ils sont supérieurs à 2TB. C'est en fait l'une des principales raisons pour lesquelles GPT est devenu populaire plus récemment, il gère des disques beaucoup plus grands beaucoup plus facilement - et signifie que ce disque fonctionnerait sur tout ce qui est capable de gérer GPT. Lorsque MBR est un peu une chose hit and mis, vous pouvez avoir une machine fonctionne parfaitement bien avec un disque dur de 4TB en tant que MBR, puis la prochaine ne reconnaît tout simplement pas de partitions sur elle.