Physique est assez facile à comprendre, c'est tangible. Vous pouvez le voir, le toucher, le tracer. C'est le support physique entre deux points, mais aussi incluant un réseau plus large -- tous les nœuds, tels que les commutateurs et les routeurs entre deux points quelconques.
La logique est plus un concept abstrait, l'organisation (topologie) du réseau. Il'est soft (configuration logicielle), non tangible. Une petite liste de nombreux exemples possibles peut être : VLAN's (réseaux locaux virtuels's/réseaux) - séparation de la couche 2 de l'OSI, sous-réseaux IP - séparation de la couche 3 de l'OSI, technologies de tunnel/VPN ... GRE, MPLS/VPLS, etc. Les systèmes autonomes, dispositifs regroupés par des domaines de gestion ou de routage communs, sont également logiques. Vous ne pouvez pas les voir en les regardant physiquement, vous devez les déduire en regardant les configurations logicielles/soft. Pensez virtualisé ; même les circuits de données sont plus virtuels que jamais... multiplexage, DWDM.
As is usually the case, Wikipedia has a better definition than my answer really provides: Network topology